HuMiChip功能基因芯片是針對人類相關微生物設計的，用于檢測人體內（人體相關組織中）微生物群落的功能組成和結構，進而探討人類健康與微生物群落之間的相互關系的高通量宏基因組檢測工具。 該芯片共設計了36,802個探針，涵蓋50,007個蛋白編碼序列并包含139個關鍵的基因家族。當中共有25,003個序列特異性探針，可專一地檢測單個特定的功能（序列）。該芯片已在人體口腔和腸道微生物群落進行了實驗測試，結果表明該芯片能清晰反映正常人群與患有齲齒和牙周炎病人口腔微生物群落與功能結構的差異，從而揭示微生物群落對疾病的響應。