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用16S/18S/ITS全長通用引物進行擴增,實驗成功率高
實驗過程無菌操作,保證實驗結果真實有效
擁有專業的實驗分析人員,項目周期短
菌種分離式培養
3-5ml
1-2個
常溫
答:細菌建議用16S全長序列,真菌建議用ITS全長。通??梢澡b定到種、屬水平。
答:由于16S/ITS擴增子涵蓋的信息不是很全面,鑒定結果通常只能作為參考,發表文章還需要進行各種生理生化指標、分子實驗等多相分類鑒定,從而提供更準確、全面的信息。
目的菌種基因組DNA使用相應引物(如16S使用27F / 1492R引物),進行擴增。擴增產物利用Sanger法進行測序。測序結果中,原始峰圖文件可使用Chromas軟件查看。該文件經過轉換后方可獲得堿基序列。
各樣品序列格式為fasta格式,如圖2中”>biao1”為樣品名,各樣品名下所列的堿基為各樣品的具體序列。
將拼接得到的序列與近緣菌株間構建系統進化樹,用于解析菌株之間的進化關系。