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建立了國內獨有的環境樣品RNA提取創新方法。
擁有從total RNA提取至上機測序全套實驗的先進設備和平臺。
擅長宏轉錄組與宏基因組的深入聯合分析，深入挖掘創新性成果。
不同生境（火山、礦山廢水、熱泉、極地等）的環境微生物群落基因表達
包括腸道微生物、口腔微生物、糞便微生物、人體組織微生物
浮游植物與微生物互作、昆蟲與微生物互作
野外采集的樣品可使用RNAlater保存（樣品體積：RNAlater=1:5），之后可將樣品于-20°C長期保存，4°C下最多1個月，25°C下最多1周。
濃度≥65ng/μl，總量≥2.5μg（單次建庫），OD260/280:1.8~2.2，RIN≥6.0，23S/16S≥1.0，無基因組和蛋白污染。
total RNA樣品請選擇干冰運輸，并提供total RNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源，同時附上QC數據。
答:由于宏轉錄組以環境中轉錄本為研究對象，分析結果中體現的是活躍/不活躍物種；宏基因組體現的是優勢物種，除此之外兩者的分析內容基本一致。宏轉錄組配合16s rDNA測序和宏基因組，可全面地揭示科學問題。
答:取樣時，盡量不要取靠近組織的部位；提取的時候采用相應的試劑盒；若有參考基因組，可通過比對分析去除宿主基因組污染。
答:普通環境樣本，測序深度默認為8G，寄生或腸道微生物，推薦10G數據量，建議根據研究目的來選擇數據量。
宏轉錄組COG（cluster of orthologous group）注釋結果。
宏轉錄組KEGG pathway注釋圖。
宏轉錄組功能豐度聚類Heatmap圖。
宏轉錄組物種組成聚類Heatmap圖。
宏轉錄組樣品基于物種分類的PCA圖。
宏轉錄組樣品基于COG功能分類的PCA圖。
