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擁有多種測序平臺,提供最佳的測序解決方案
擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺,實驗周期短,質量可靠
擁有專業的生物信息團隊和大型計算機,個性化售后分析服務
挖掘與人類健康、畜牧業安全、植物保護、林業農業安全、生物除草相關病原菌的致病基因
適合沒有任何參考序列信息的單個真菌,有利于探索發現新型菌株
解讀與酸奶發酵、能源利用、藥物生產相關的工業菌中新菌株或優勢菌株的功能基因及高產/環境適應機制
濃度≥30ng/μl,總量≥2μg,OD260/280應在1.8~2.0間,主帶明顯,無降解,無污染。
濃度≥50ng/μl,總量≥20μg,OD260/280應在1.8~2.0間,主帶明顯,無降解,無污染。
樣品來源一定要單一菌落無污染,否則會嚴重影響測序結果的質量。
答:相對于細菌來說,真菌的基因組、質粒、樣品等情況都很復雜。目前,已經公布基因組序列的真菌物種很少,大多缺乏參考序列、基因組大小、GC 含量、重復序列、質粒等信息。然而,通過 survey 可以大概知道這些情況,特別是對于三代測序為基礎的真菌精細圖,由于測序成本高,為避免數據浪費,通過Survey來預先確定真菌的大小,選擇合適的測序量,顯得非常重要。
答:真菌基因組的重復序列、GC含量、雜合率、染色體數目等是影響基因組de novo拼裝效果的關鍵因素,如果待測菌株基因組或其近源物種基因組已有報道,可以根據已報道的基因組信息分析待測菌株重復序列、GC含量、雜合率、染色體數目等特點制定合適的測序策略。如果沒有相關信息,可以根據基因組survey評估基因組特點后制定相應的測序策略。
答:當GC含量大于65%或小于35%時,會對測序和組裝有一定影響會對測序和組裝有一定影響會對測序和組裝有一定影響,需要構建不同長度測序文庫,并通過加大測序量才能夠達到組裝標準,但目前三代Pacbio RS II長讀長的測序技術能很好的克服這些問題。